Расчет по начисленным и уплаченным страховым взносам

В карточке НУ для начисления время проставлено?

Вадим, какое время Вы имеете ввиду?
Отработанное время ФАКТИЧЕСКИ стоит, в календарных днях тоже.

Не отработанные дни, а там, где начисления дополнительные вводите.

Когда в карточку НиУ заносите начисления по больничному листу,
в Начислениях в колонке Время должны быть указаны количество дней болезни
1 Больничный 8.00 1000.00 0
Для того, чтобы количество дней болезни в карточку НиУ заносилось автоматически, в настройке (F4) бланка
6.01. Расчет сумм оплаты больничных листков (за 2 года, 2011)
в строке 1 проставьте:
1 Записывать время Да

Вот что стоит в настройках:

Настройки это только запись больничного в карточку НУ.
Посмотрите как больничный в самой карточке НУ записан.
Когда вводишь начисление, там после ввода кода начисления,
идет колонка "Время".
Там должно стоять количество дней, если их нет - введите.
Потом надо рассчитать зарплату, чтобы эти данные подтянулись в отчет.

Когда в карточку НиУ заносите начисления по больничному листу, в Начислениях в колонке Время должно быть указаны количество дней болезни.
1 Больничный 8.00 1000.00

Если в карточках работников эти данные есть, то они и попадут в отчет по ФСС.
Настройка у Вас правильная.
Когда Вы делали расчет больничного и вносили расчет в карточку работника,
может такой настройки еще не было и количество дней в карточку работника не записалось.
Если в карточке работника дни больничного не указаны, внесите их.

И зарплату пересчитайте, иначе они не подтянутся в отчет.