Мои комментарии

А у меня совпадают.

Может быть Вы не увидели графы для изменения вывода годов - в правом верхнем углу балнка расчета больничных?

Учтите что для каждой операционной среды свой БиПринт

Она нужна, т.к. при перемещении работников (в зависимости от ведения плана счетов) лучше заменять табельный номер нежели путаться.
Например, был СМ, а стал ШТ. В этом случае лучше его табельный номер заменить с 70/СМ/ИИИ на 70/ШТ/ИИИ

А версия программы - ОРН, УСН, бюджет?

У меня также обновление от 23.12.2013 г. и все исправления.
Разбивки на СЧ и НЧ не производится.
Идет начисление только СЧ.
Какая у Вас версия программы?
Какое последнее исправление установлено?

В книге указываются данные в зависимости от тех настроек счетов, которые Вы указали в книге.Если у Вас в книге счета расходов указаны как 60-51, то при наличии такой проводки в ЖХО эта проводка в книгу попадет.

Бланки для всех баз одинаковые? Вы свои бланки не пишите?
Если все едино, то в Установке/Настройки/Папки сделайте от папки базу только Арзивы и ДАТА, а все остальное от текущей директории и обновляйте только саму программу а не базы.

Видимо что-то не то установили.
Войдите в Меню Зарплата и Кадры/Заплата/Настройки/Шкала вычетов.
В первой строке введите в колонке Сумма - о, а в колонке Коэффициент - 1.
Во второй строке 20000 и 0 соответственно.

Измените год расчетного периода на 2013 г. и заново сформируйте сведения.
Меню/Зарплата-Кадры/Зарплата/Расчетный период

Модернизировано ОС и 0-ая остаточная стоимость?

Пройти тем же путем.

Войдите в Меню Операции/Счета-фактуры/Настройка печатных форм 2.0
в строке Форма выберите Накладную Торг-12, а в строке Шаблон - Пользовательский ДА
и в строке "18 Количество строк на страницу" установите 65

Не забудьте при формирвании установить Расчетный период 2013 г.

В этой таблице указана база для взносов.
Больничные в базу не включаются и взносами в ПФР и другие фонды не облагаются

Мне кажется Тестер еще не готов к сдаче 2-НДФЛ

Это уже возможно.Просто вместо ОКАТО укажите код ОКТМО, т.к. бланк еще не изменился и в нем так и есть указание кода ОКАТО, но ФНС сказало, что вместо него просто указать коды ОКТМО

А в каких таблицах? В какихграфах?

Базы переносятся методом простого копирования

Заново скачайте обновление.