Мои комментарии

Не надо так делать.
Надо при выписке счёт-фактуры по реализации, зачесть авансовую счёт-фактуру. Для этого в бланке счёт-фактуры есть графа для зачёта авансовых счёт-фактур.

Евгений, спасибо за разъяснения, так теперь и делаем.

Т.е. через ручной ввод авансовый СФ ввести нельзя?

Насколько я понял, пообщавшись с бухгалтерами, там ситуация такая: этот счёт-фактуру выставляет наша организация, т.е. она попадает сначала в книгу продаж. Однако потом её нужно отразить ещё и в книге покупок, как раз из-за аванса. И вот в книгу продаж заносят её обычным образом (через бланк выставления СФ), а в книгу покупок - забивают ручным вводом.

Хотя, наверно, если делать один и тот же СФ и как выставленный, и как полученный, то ничего страшного произойти не должно, таблицы в базе для них разные. Надо попробовать.

По логике вещей, поле "Номер и дата док-та оплаты" при ручном заполнении - это просто строка, она не подразумевает, что такой документ реально существует в базе, верно?

Да. У нас как раз для авансов (код операции 02), и всё равно не заполняется.

Евгений, спасибо, теперь разобрался.