Мои комментарии

В этом случае будет обновлено меню.
Оно просто перезаписывается, что конечно же неправильно. Должны параметры меню считываться, проверяться и необходимые пункты исправляться. Сейчас этого не делается. Поэтому, если есть пользовательские пункты меню, то их надо восстанавливать самостоятельно после такой процедуры.

Попробуйте
Операции\Администрирование\Структура меню и бланков\Старая структура

Информации для принятия решения не достаточно.
Подумайте над разделением бизнеса. Один торгует, другой производит, третий оказывает услугу.
Возможно применение давальческой схемы изготовления.
Не вникая в мелочи, хорошего совета не получится.
Сначала надо выслушать (аудит) потом дать совет.
Но решение принимать только вам.

Для начала, поставить обновление.
С ноября 2016 были изменения в программе по 2-НДФЛ.

Если повторится, то скорее всего проблемы с сетевым оборудованием.

Файлы помощи не обновлены.
Версия локальная или сетевая?
Текущая папка совпадает с папкой программы?

Таблица отображается нормально.
При старте и сказала, что индекс Реквизитов нуждается в обновлении.
Если не обновить, то куча ошибок и всякие слова про компиляцию и Реквизиты пустые.
Если обновить, то всё нормально.
Что-то с сетью. Реквизиты активно проверяются при старте программы. Где-то произошёл конфликт. Индексы и поломались.

Получил, но ничего не нашёл.

А вот с файлом Реквизитов видимо что-то случилось.
Там строчек раз-два и обчелся.

Этого не нашёл.

Вин 10, поставил старый ключ NetSentinel, запустил программу и в меню программы нашёл регистрацию для другого ключа.
Ключ нашёлся.
Драйвер ключа http://modus.ru/software/buhuchet/infobuchgalter/platform8.6/distribution/

Не знаю, бывали просто ошибки компиляции связанные с Определениями и Реквизитами.
Если сохранились старые Определения и Реквизиты, то пришлите на ib@modus.ru посмотрю.
Самому интересно.

Я имел ввиду, отложены бланки от базы или от текущей папки?
Компиляция бланков не зависит от базы, разве что в определениях или в реквизитах поставить какую-нибудь служебную переменную.
Тогда да.
Для начала очистить Определения, а затем и Реквизиты.
Посмотреть, что поможет.

Бланки от базы?
Или как?

В документах есть ещё бланк "2. 3. Порядок формирования сведений РСВ-1 (Путеводитель)"
Откройте его.

То ли 8.707, то ли 8.710.

Могу прислать.

Попробуйте ещё раз, у меня всё скачалось нормально.

Добрый день!
Не формирует книгу продаж.
Ошибка: В базе данных нет поля "ONTAV" SF_TOP.IBL :(3,4244).

Пересчитайте бланк "ХХХХ. Проверка (изменение) структуры базы данных (формат 1.54)"
Воспроизведите ошибку полностью.

Нашёл такое поле в файле DATA\SCF\SF_WRITE.DBF
Удалил его. Потом пересчитал бланк "ХХХХ. Проверка...", поле восстановилось.
Тогда присылайте базу на ib@modus.ru

Однако, Базы Организаций, ФизЛиц,Банков, Сч-фактур и т.п. не конвертируются в новый формат, коды ОКАТО не заменяются на ОКТМО...,структура сетевых баз не поменялась - логично.

Вот здесь поподробнее.
Что Вы понимаете под "Базы Организаций, ФизЛиц,Банков, Сч-фактур"?
Какие действия производятся?
Где хотите поменять ОКАТО на ОКТМО? В реквизитах? Для этого достаточно удалить в определениях Определение "КОНФИГУРАЦИЯ".

Пытаюсь обновить сетевые Базы до 8.819, вот тут-то все описанные ранее проблемы в полный рост. Дак, как быть? Может обновляюсь не так (копированием и переносом Папок из рабочей обновленной в старую сетевую)?

Первый раз слышу про обновление базы копирование и переносом. Как это?!
Всегда обновлялась программа, а база обновлялась сама до требуемого уровня.
Только при необходимости совершались дополнительные действия.

Надо убрать знак "/" из имени филиала.

Вопрос по конкретному бланку (2.1. Расчет страховых взносов (ПФР, ФСС, ФОМС)") .
Если его из резервной копии достану, январь 17 г. правильно рассчитает?

Вроде правильно.

У Вас версия программы меньше 8.819?
Если так, то обновите системные файлы.